山东省寄生虫病防治研究所座落于“孔孟之乡、运河之都”的济宁市，隶属于山东第一医科大学（山东省医学科学院）。是由1950年成立的“华东军政委员会卫生部黑热病防治总所”（1953年改为“山东省黑热病防治所”）与1955年成立的“山东省丝虫病防治所”于1960年合并组成。经过70年的发展，目前已成为山东省唯一的集寄生虫病与消化系统疾病防治、科研、临床医疗、人才培养为一体的省属专业机构，是世界卫生组织（WHO）淋巴丝虫病和绦/囊虫病合作中心，山东囊虫病治疗中心，山东省消化系统疾病防治中心，博士、硕士研究生培养单位，出版发行《中国病原生物学杂志》，北大中文核心期刊基础医学类排第二名，医学昆虫学、寄生虫病防治专业为省医药卫生重点学科，寄生虫分子免疫学为省医科院重点学科，消化病专科为省医科院临床重点专科，媒介生物学实验室为省医药卫生重点实验室。研究方向为寄生虫病原生物学、免疫诊断学。调查研究山东省主要疾病媒介的种类、分布、生态习性、传病作用、防治策略等及医学昆虫的生物防制、媒介蚊虫抗药性分子机制等。
单位拥有在职职工214人，其中高级技术职称者46人，博士学历人员10人，硕士学历人员65人，已形成以硕博士为主的专业技术队伍。其中泰山学者特聘专家1人，泰山学者青年专家2人，齐鲁卫生与健康杰青人才1人，享受国务院津贴专家1人。是全国首批具有硕士培养资格的单位，承担全省寄生虫病、媒介昆虫和消化系统相关疾病的预防控制、科学研究和病原生物学、内科学（消化病学）专业研究生教育培养工作。目前拥有博士生导师1人，硕士生导师13人，共招收和培养研究生112人。目前省寄研所拥有业务用房3.5万平方米，固定资产1.1亿元。具有较强的科研、防治、临床医疗、研究生培养和专业技术人员培训等综合能力。
先后有12名专家担任国家卫生健康委寄生虫病专家咨询委员会副主任、专家组组长、委员，8人在国家级学术团体担任常务理事、理事职务，有突出贡献专家4人，享受政府特殊津贴8人。先后承担并完成国家级、省部级、厅院级科研课题450余项，荣获各级科技成果奖110余项，其中国家科技进步一、二、三等奖5项；全国科学大会奖2项；省部级成果奖37项。主编及参编寄生虫病专著60余部，公开发表论文1100余篇。下设山东第一医科大学附属消化病医院，拥有国内著名的寄生虫病诊疗专家，在寄生虫病的诊治方面处于国内领先地位。积极开展对外科技合作与技术交流，承担完成与世界卫生组织合作课题12项，获得国家级成果奖3项、省部级奖励16项；接待WHO官员、国外专家、访问学者共计54批164人次。选派8批专家到塞舌尔执行援外任务，派遣疟疾专家组到非洲执行援外任务，为国争得了荣誉。
70年来，以全国著名黑热病专家王兆俊研究员、全国著名丝虫病专家仲崇祜研究员、全国著名疟疾专家程义亮研究员为代表的一代又一代山东寄防人紧紧围绕严重危害人民健康的寄生虫病和消化系统疾病大力开展防治工作，经过不懈努力，总结出一整套成功的防治经验，在防治策略、防治技术、防治方法、疾病监测、效果评价等方面在国内同行业保持领先地位。分别于1958年、1983年、1988年在全国率先实现基本消灭黑热病、丝虫病和疟疾，取得全国寄生虫病防治工作的“三连冠”，1971年以来未发现黑热病人，2004年全省消除丝虫病，2012年起保持无本地感染疟疾病例报告，2019年通过国家卫健委组织的消除疟疾考核评估，全省实现消除疟疾的目标。山东省在全国率先基本消灭三大寄生虫病，取得了彪炳史册的成就，为保护全省人民的身体健康、促进山东经济和社会发展做出了巨大贡献，为世界防治寄生虫病提供了成功的经验。
山东省寄生虫病防治研究所设有省属消化病与寄生虫病治疗专科医院——山东第一医科大学附属消化病医院，经过70余年的风雨历程，现已发展为集医疗、科研、教学、防治、康复为一体的省级消化病专科医院，是省、市医保定点医院。医院设有消化内科、普外科、肛肠外科、寄生虫病科、肝病中心等20多个临床医技科室。可开展消化病、外科、寄生虫病、肝病、口腔等方面疾病的诊治服务。其中消化内科为特色专科，建成了胃肠、肝胆胰及消化内镜等亚专科完善的服务体系，在消化系统疾病诊疗领域达到了较高的水平。消化内镜中心拥有高清胃肠镜、超声内镜、以色列生产的胶囊内镜、电子小肠镜、十二指肠镜等各种内镜设备，是山东省拥有内镜设备最全的医疗单位，收治患者已覆盖20余个省(市、自治区)以及韩国、印度等国家。消化病医院将秉承“创新、厚德、弘毅、济世”的院训，做好包括消化系统疾病在内的疾病预防、诊断和治疗，提高医院服务能力，努力建成让患者满意、社会满意的省级专科名院。
一分耕耘，一分收获。山东省寄生虫病防治研究所先后被原国家卫生部、省卫生厅、省文明委授予“全国卫生先进集体”、“全国丝虫病防治先进集体”、“全省卫生先进集体”、“全省丝虫病防治先进集体”、“省级文明单位”的光荣称号。2020年，因在抗击新冠肺炎疫情中做出的突出贡献，被中共山东省委组织部、山东省人力资源和社会保障厅、山东省卫生健康委员会授予“山东省抗击新冠肺炎疫情先进集体”荣誉称号。此外，先后16人被推选为国家、省、市级人大代表、政协委员，6人被评选为全国、省、市级劳动模范。
乘风破浪会有时，直挂云帆济沧海。随着深化改革科教融合的不断深入，山东省寄生虫病防治研究所将在山东第一医科大学（山东省医学科学院）党委的领导下，继承弘扬“坚定信念、恪尽职守、勇于探索、攻坚克难、艰苦奋斗、无私奉献、团结协作、守护健康”的山东寄防精神，踔厉奋发，笃行不怠，再创事业新辉煌！
